高雄氣爆和登革熱爆發地圖視覺化

Method (proposal)

原始資料： http://khd.kcg.gov.tw/Attachment/000001_000401_000001/files/1031112-%E7%99%BB%E9%9D%A9%E7%86%B1%E7%96%AB%E6%83%85%E5%BF%AB%E8%A8%8A.pdf

Issue:

名詞 (待完善):

預期產出 : 作成以下 timeline 地圖

範例 : healthmap.org/ebola/#timeline

每週定期抓資料, 含各種不同法定傳染病

有沒有辦法找到 高雄水溝蓋的map ?  如果能做水溝蓋的map 再對比 病例發生 , 不知道會不會有相關 ?

   例: 高雄地下管線圖 http://zbryikt.github.io/visualize/kh-pipe/

  • 20141109 unconf lighting talks
    •

    Fact

    2014 高雄氣爆事故

    2014年高雄氣爆事故（又稱高雄石化氣爆事件），是2014年7月31日23時至8月1日凌晨間，發生在臺灣高雄市前鎮區與苓雅區的多起石化氣爆炸事件，經初步調查，應為丙烯爆炸所致。截至9月2日，已知有32人死亡、308人受傷，其中包括7月31日晚上約9點，接受民眾報案疑似有瓦斯洩漏而前往援助、調查的消防隊員和環保署毒災應變隊員，並造成至少包括三多一、二路、凱旋三路、一心一路等多條重要道路嚴重損壞。臺灣中油有安管中心可監測高雄市所有石化管線是否有問題（壓力變化）、中油也確實早知道管線有問題，但當高雄市政府消防局119勤務中心多次詢問管線破損的相關狀況時，中油安管中心卻未告知，使原本可能可以阻止的氣爆發生。

    2014 登革熱

    Wikipedia http://zh.wikipedia.org/wiki/%E9%AA%A8%E7%97%9B%E7%86%B1%E7%97%87

     Question: 到底氣爆和登革熱有沒有關係 ?

    Data:

     登革熱 歷年趨勢 : 2014 特別多

    http://nidss.cdc.gov.tw/SingleDisease.aspx?pt=s&Dc=1&Dt=2&disease=061&d=1&s=determined_cnt&i=all&RK=Y

    Open data: 疾管局 (每週 vs 地區)  "excel data 需要周周更新"

  • 今年趨勢 http://nidss.cdc.gov.tw/Nidss_Report_Timer.aspx?Pt=s&dc=1&dt=2&disease=061&d=1&i=all&s=determined_cnt&rk=W&Y1=2014&Y2=2014&MW1=1&MW2=46&Area=07&City=07&Town=0&Q=H&mr=1 (excel檔)
    •

    CDC 已經畫了地圖 靜態地圖 (但看不出時序變化)

    但是民眾不容易追蹤時間和地區的變化

    需要 Better map ! by @Chewei such as "google map" or "Open street map"

    高雄登革熱疫情防治整合系統

    資料來源 : http://dengue.kcg.gov.tw/KCGDengue/Mobile.aspx

  • Crawler 
    •

    isacloud https://gist.github.com/youchenlee/bb3e4449b5268e1eec83

    mcdlee : https://gist.github.com/mcdlee/8cf459fa3b3c490dc67d

    tomstone: https://gist.github.com/t0mst0ne/019ec211dffb954ddf6a

  • CSV 格式
    •

    mcdlee : https://gist.github.com/mcdlee/d550b485b1684e3c33a1

    tomstone :https://github.com/t0mst0ne/dengue.kcg   data 放在這個 Repositories中 

  • Data mining 
    •

    tomstone : (ipython + nbviewer) http://nbviewer.ipython.org/github/t0mst0ne/dengue.kcg/blob/master/t0mst0ne.dengue.kcg.ipynb

    以下為2014 至今各里的趨勢圖: (縱軸:單日確診 , 橫軸:日期, 顏色:508個里)

    [每日 每里 新確診]

    [每日 每里 累積確診]

    [ 按區域 , time series, plotly ]

    https://plot.ly/~iamtomstone/2

  • Visualization : Trend + Map on server
    •

    lycheetw : http://lycheetw.github.io/KaohsiungDengueMap/

    Discussion

    高雄氣爆時序圖 http://timemap.kuansim.com/hychen/kaohsiung-gas-explosion

    今天有以里為單位的數據了 只有總量沒有時序 http://khd.kcg.gov.tw/Attachment/000001_000401_000001/files/1031112-%E7%99%BB%E9%9D%A9%E7%86%B1%E7%96%AB%E6%83%85%E5%BF%AB%E8%A8%8A.pdf

  • 視覺化目的: 
    •

    人口密度與疫區比較 2014/12/2

    高雄的友人跟我聊到，登革熱最嚴重的是三民區，而氣爆是在苓雅區，兩者無關係。

    所以就嘗試以人口密度與蚊疫地理分布區做對比，請參考下圖。

    圖片中顯示出人口集中的地區以及病例分佈圖是重疊的，

    列舉病例人數最高的三民、鳳山、前鎮、苓雅，以及小港五區，

    可得出這五區緊密相鄰，並且人口密集，也有捷運相連接的共通點。

    最後一點就是，友人稱因大量投藥的關係，高雄的蚊子抗藥性非常強，一般投藥已無效。


    •

    資料來源:

    1. wiki高雄人口分布示意圖2009：

    http://zh.wikipedia.org/wiki/%E9%AB%98%E9%9B%84%E5%B8%82#mediaviewer/File:Population_density_map_of_Kaohsiung_%28Dec_2009%29.svg

    2. 疾管署傳染病統計：

    http://nidss.cdc.gov.tw/NIDSS_DiseaseMap.aspx?Pt=s&dc=1&dt=2&disease=061&d=3&i=0&s=determined_cnt&a=07

    3. 高雄人口數量：http://zh.wikipedia.org/wiki/高雄市

    4. 高雄行政區規劃圖：http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/9/90/Kaohsiung_City_Districts.png

    氣候變遷及今年氣象與發病時間的比對

    依據氣象局的資料做了一些整理，溫度變化的部分是5月到6月瞬升5度，雨量部分也是5、6月比去年明顯增加，濕度部分今年4~5月是最高點。

    接著看疾管局發病日的表格，在第20年週(5月)的時候發病人數開始持續出現，在第24年週(6月)開始增加。目前資料並不多，希望可以陸續增加。

    公視訪問諸位專家: 

    part 1 https://www.youtube.com/watch?v=mXpK6jV5YpI#t=1942

    part 2 https://www.youtube.com/watch?v=mXpK6jV5YpI#t=2240 氣爆有關?

    part 3 https://www.youtube.com/watch?v=mXpK6jV5YpI#t=2548 Defense : 澄清無關

    part 4 https://www.youtube.com/watch?v=mXpK6jV5YpI#t=3088 新加坡經驗: Evidence based policy making , task force 

    Finally : 公共衛生教育失敗 , 需改進 

    筆記區：有話好說：登革熱大爆發！海水真能鹹死孑孓？

    高雄大型建案與工地資料

    1. 需要釐清：公共建設、建築工地、空地，與登革熱病媒蚊孳生的實質關聯性，是什麼？
    2. 與登革熱病媒蚊相關的工地與空地，初步歸納有以下可能：
    1. 高雄市政府建築執照存根查詢
    2. 國外類似主題地圖：https://buildingeye.com/ 正在營造中的建築物的資訊，美國部分城市。

    Big Data in infectious disease

    1. Using Web Search Query Data to Monitor Dengue Epidemics: A New Model for Neglected Tropical Disease Surveillance http://www.plosntds.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pntd.0001206 

     2. Big Data Opportunities for Global Infectious Disease Surveillance 

     http://www.plosmedicine.org/article/fetchObject.action?uri=info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pmed.1001413&representation=PDF

      簡單講, 就是利用分析歷史資料 + 即時資料 => 即時更新 risk map => 找到新病源聚集區 => 找到為何聚集 => 趕緊採取措施 ; 然後讓以上過程自動化

      

    Open data in infections disease

    1. 提供即時資料下載, 供市民皆可使用
    2. 讓更多人可以分析研究提供對疾病控制更有用的方式

    Forecast of Dengue Incidence Using Temperature and Rainfall 

    待整理

    與登革熱病例間具顯著意義的氣候因子: 

    當週及前一週之平均相對溼度、平均溫度

    當週之降雨百分比、平均日照率

    摘自

    [吳佩芝、陳佩綉、郭浩然、龍世俊，2004，氣候變遷對台灣居民傳染性流行性疾病健康風險之影響，成功大學環境醫學研究所、中央研究院地球科學研究所研究計畫報告]

    [ 張筱玲、賴淑寬，2006，氣象資料於疾病監測之應用，行政院衛生署疾病管制局95年度科技研究發展計畫報告]  

    [中央氣象局 MOTC -CWBCWBCWB-99 -2M -13 計畫報告]